租房分两家、楼上的一家未交水费搬走了、所欠水费是该楼下房东索要还是自来水公司向其索要

这要看谁和自来水公司签订的用水合同。如果是房东签订的，则由房东向其索要。现在自来水公司把整个儿楼的水都停了，说明是和房东签订的供水合同。应该由房东向自来水公司交纳了水费后再向其追偿。